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Cette action s'inscrit pour l'ur099, dans le sous
projet DIAPAZON.
C'est une opération financée en partie par
PROOF |
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L'utilisation de ces données
est soumise aux conditions:
Nous vous invitons à
respecter ces conditions d'utilisation afin de faciliter les
échanges de données au sein de la communauté
scientifique. |
Méthodologie: Production bactérienne
(incorporation de TdR)
Les mesures de production bactérienne
n’ont été réalisées qu’à partir de la Diapalis 4. La production
bactérienne a été estimée à partir de la méthode d'incorporation de
Thymidine tritiée [Methyl-3H] (TdR).
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Les échantillons (15-30ml)
sont inoculés avec 15nM de TdR (concentration finale) et
incubés 90 minutes sur le pont du bateau dans des incubateurs
alimentés avec l'eau de surface. En fin d'incubation, les
échantillons sont formolés (37% tamponné) et filtrés sur
filtres 0.2µm (Nuclepore) préalablement imbibés de thymidine
non radioactive. En fin de filtration, le vide est rompu et
les macromolécules sont précipitées avec de l’acide
TriChloroAcétique (TCA 5% w/v) pendant 15 minutes à 4°C. Le
vide est ensuite rétabli et les membranes sont rincées trois
fois avec 5ml de TCA 5%. La quantité de radioactivité présente
sur le filtre et donc incorporée par les bactéries est mesurée
à l’aide d’un compteur à scintillation. Des témoins sont
réalisés régulièrement à chaque station avec des échantillons
formolés avant ajout de TdR et incubés en parallèle. Les
détails de la méthode sont décrits dans Torréton et Dufour
(1996). |
L'effet de la température est corrigé
à partir des températures in situ données par la CTD selon
l'équation d'arrhénius avec un Q10 = 1.63 (Jacquet, pers.
comm.).
Les données (moyenne sur 2 ou 3
sous-échantillons) sont exprimées en pMTdR h-1 ou en
valeurs intégrées en nmolTdR/h/m2. Pour convertir ces valeurs en µgC
l-1 h-1 on peut utiliser le facteur de
conversion de 12.4 fgC cell-1 (Fukuda et al., 1998) et de
2.1018 cell mol-1 TdR (Ducklow and Carlson,
1992)
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Production
bactérienne
(Assimilation thymidine
tritiée)
Les stations sont les traits
de la sonde, c'est-à-dire une unité espace
(latitude/longitude) / temps. |
| Lagon Ouinné |
xls |
| Baie du Santal |
xls |
| Chenal des Loyauté |
xls |
| DIAPALIS 7 |
xls |
| DIAPALIS 9 |
xls |
Références
Ducklow H. W. and Carlson C.A. (1992)
Oceanic bacterial production. Adv. Microb. Ecol., 12,
113-181.
Fukuda, R., H. Ogawa, T. Nagata and I. Koike (1998).
"Direct determination of carbon and nitrogen contents of natural
bacterial assemblages in marine environments." Appl. and Environn.
Microbiol., 64,
3352-3358.
Jacquet, S. (2001). Importance comparée des biomasses et
productions bactérienne et primaire planctonique et leurs relations
avec les variables physico-chimiques dans le lagon Sud-Ouest de
Nouvelle-Calédonie. Rapport de DEA, Université de Pierre et Marie
Curie Paris VI, 32 pp.
Torréton J.-P. and Dufour P. (1996) Bacterioplankton
prodution determination by DNA synthesis, protein synthesis, and
frequency of dividing cells in Tuamotu atoll lagoons and surrounding
ocean. Microb. Ecol., 32,
185-202.
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