FICHIERS_SOURCES_DE_REFERENCEMENT: NOUS DISPOSONS DE TROIS SOURCES DE REFERENCEMENT : LE PREMIER FICHIER SOURCE DE REFERENCEMENT EST TRANSFICROSCOORD.TXT Il s'agit du fichier rosette coordonnées qui constitue notre fichier trame Le référencement est rattaché aux données CTD LE SECOND FICHIER SOURCE DE REFERENCEMENT EST TRANSCOORDOPERALAMER.TXT Il s'agit des fichiers des opérations à la mer avec les coordonnées Le référencement esr rattaché à l'opération à la mer effectuée (ils tiennent donc compte de toutes les opérations à la mer effectuées mais on ne dispose de coordonnées que lorqu'il y a une opération) LE TROISIEME FICHIER SOURCE DE REFERENCEMENT EST TRANSTHERMOALL.TXT Il s'agit des fichiers du thermosalinographe qui fournissent la position du navire à chaque minute Ces trois fichiers sources possèdent des indications communes et des indications particulières PREMIER FICHIER SOURCE DE REFERENCEMENT: TRANSFICROSCOORD.TXT (pour transmission fichiers rosette coordonnees = trame de référence) Emplacement du fichier : D:\pomme\ctdraw\etaloxlp\refdesc\oxygdefexpl\fichiers_rosette_complets\ficros_coord Fichier de transmission transficroscoord.txt a été réalisé en août 2004 il se trouve également dans ...\ctdraw\fichiers_reunion_3sept2004\ficros_coord Objectif : explication des fichiers résultats "ficrosdficcoordpxly_modif_cor" .xls et .txt Le x symbolise le numero de campagne : pomme 1, 2 ou 3 Le y symbolise le numero du leg : leg 1 ou leg 2 Remarque : la campagne pomme 0 n'est pas prise en compte ici Remarque : ces fichiers "ficrosdficcoordpxly_modif_cor" se distinguent des fichiers "ficrosdficcoordpxly_modif" par des mises en forme effectuées sur le choix du nombre de décimales (chaque colonne comporte le même nombre de décimales) et l'indication des unités de mesure Rappel : La campagne POMME comprend trois campagnes qui se subdivisent chacune en deux leg (exemple : Pomme 1 leg 1 et Pomme 1leg 2 =p1l1 et p1l2). Chaque leg comprend un certain nombre de stations dont la numérotation peut être continues ou non. Pour P1L1 : les stations vont de 1001 a 1079, sans discontinuite Pour P1L2 : les stations vont de 1080 a 1206, avec absence de fichiers pour certaines stations Pour P2L1 : les stations vont de 2001 a 2081, avec absence de fichiers pour certaines stations Pour P2L2 : les stations vont de 2082 a 2416, avec absence de fichiers pour certaines stations Pour P3L1 : les stations vont de 3001 a 3083, avec absence de fichiers pour certaines stations Pour P3L2 : les stations vont de 3084 a 3339, avec absence de fichiers pour certaines stations Détail des fichiers "ficrosdficcoordpxly_modif_cor" : Les données des variables commencent à la ligne 4, les lignes 1 à 3 décrivant le nom des variables, l'origine des fichiers et leurs unités de mesure colonne 1 : n°ligne : numero de ligne, colonne 2 : n°station : numero de station, colonne 3 : n° position btl : numero de position de la bouteille qui correspond au numero de la bouteille, colonne 4 : prof : profondeur en décibars (dbars), colonne 5 : station : numero de station, colonne 6 : juldeb : jour de début en jour julien de l'année (jour 1 = 1er janvier 2001) en jour centmillième colonne 7 : lat cent : latitude en degré centmillième (d'où une précision de 10-5), colonne 8 : long cent : longitude en degré et en centième de degré (le signe moins indique une longitude ouest), Détails complémentaires : Les "NaN" signifient Not a Number selon la convention IEEE. On les emploie lors d'absence de données, le langage Matlab n'acceptant pas de vide dans les tableaux. SECOND FICHIER SOURCE DE REFERENCEMENT: TRANSCOORDOPERALAMER.TXT (pour transmission fichiers coordonnees operation a la mer = fichiers des operations a la mer avec les coordonnees) Emplacement : D:\pomme\ctdraw\etaloxlp\refdesc\pommeres_def\operalamer\coord_operalamer Fichier de transmission "transcoordoperalamer.txt" a ete realise en août 2004 il se trouve également dans ...\ctdraw\fichiers_reunion_3sept2004\coord_operalamer Objectif : explication des fichiers résultats "result_concat_julthermo_pxly_cor" .xls et .txt Le x symbolise le numero de campagne : pomme 1, 2 ou 3 Le y symbolise le numero du leg : leg 1 ou leg 2 Remarque : la campagne pomme 0 n'est pas prise en compte ici Remarque : ces fichiers "result_concat_julthermo_pxly_cor" se distinguent des fichiers "result_concat_julthermo_pxly" uniquement par des mises en forme (choix du nombre de décimales et précision des unités)) Ces fichiers contiennent la totalité des opérations effectuées à bord du navire Afin de pourvoir disposer des coordonnées (en terme de latitude et de longitude) pour chaque opération, nous avons effectué une concatenation entre les fichiers jourjulien et les fichiers thermoall (Les fichiers thermoall sont les fichiers du thermosalinographe corrigés (surface)) Ces derniers disposent de la position du navire à chaque minute et constituent notre fichier source en terme de référencement officiel Remarque : différence au niveau des fichiers résultats entre pomme 1, 2 et pomme 3 : pomme 3 leg 1 et 2 diffèrent au niveau de trois colonnes sur les quatre dernières : TQP est remplacé par TPRCOR SAL est remplacé par SALCOR (salinité corrigée) FLAG reste inchangé: flag TSIS est remplacé par TCUVE (température de la cuve) Détail des fichiers "result_concat_julthermo_pxly_cor" : Les données des variables commencent à la ligne 4, les lignes 1 à 3 décrivant le nom des variables, leurs unités de mesure et l'origine des fichiers colonne 1 : campagne colonne 2 : leg colonne 3 : année campagne colonne 4 : jours colonne 5 : mois colonne 6 : heures TU colonne 7 : minutes colonne 8 : secondes colonne 9 : opérations à la mer (heures TU) colonne 10 : stations colonne 11 : stations identiques ? colonne 12 : sites colonne 13 : jours julien (arrondi à 3 décimales) colonne 14 : jour julien (à 5 décimales, donc plus précis): jour julien de l’année 2001, en jour centésimal, avec 5 décimales, incrément d’une minute.le temps de référence est le temps TU, issue de la centrale Atalante. colonne 15 : jour (JJ) colonne 16 : mois (MM) colonne 17 : annee: l'année du siècle (2001), (AA) colonne 18 : heure: l'heure TU (hh) colonne 19 : minute (mm) colonne 20 : la latitude, en degrés DD. Minutes MM et décimales de minute ddddddd, DD.MMddddd, + pour l’hémisphère Nord colonne 21 : la longitude, en degrés DD , minutes (MM) et décimales de minute, -DD.MMddddd, - pour Ouest colonne 22 : TQP (ou TPCOR) en degrés celsius : TQP pour thermomètre à quartz de proue, indique la température de surface de l’eau de mer prise et mesurée à la proue du navire. Degrés Celsius, 3 décimales. TPCOR pour température de proue corrigée. colonne 23 : SAL (ou SALCOR /1000) : SAL pour salinité (PSU, indique /1000), SALCOR pour salinité corrigée colonne 24 : FLAG : Flag indiquant si la salinité est issue du Thermosalinographe "SIS" (flag 1) ou du thermosalinigraphe LPCM, (flag2). colonne 25 : TSIS (ou TCUVE) en degrés celsius : TSIS pour thermomètre du thermosalinographe "SIS" (Atalante), indique la température donnée à titre indicatif. TCUVE pour température de la cuve Remarque : redondance d'information au sein des fichiers parfois car les colonnes 1 à 13 sont issues des fichiers jour julien et les colonnes 14 à 25 sont issues des fichiers thermoall Les fichiers thermoall pour p3l1 contiennent une absence d'informations pour la journée du 30 août 2001 de 7h55 à 19h00, donc on a mis des NaN Détails complémentaires : Les "NaN" signifient Not a Number selon la convention IEEE. On les emploie lors d'absence de données, le langage Matlab n'acceptant pas de vide dans les tableaux. TROISIEME FICHIER SOURCE DE REFERENCEMENT: TRANSTHERMOALL.TXT (pour transmission fichiers THERMOall) Emplacement : D:\pomme\ctdraw\etaloxlp\refdesc\pommeres_def\ficsurfok Fichier de transmission "transthermoall.txt" a ete realise en août 2004 il se trouve également dans ...\ctdraw\fichiers_reunion_3sept2004\ficsurfok Objectif : explication des fichiers "pxlgyTHERMOall" Le x symbolise le numero de campagne : pomme 1, 2 ou 3 Le y symbolise le numero du leg : leg 1 ou leg 2 Rq: ces fichiers s'ouvrent avec wordpad Ces fichiers disposent de la position du navire à chaque minute et constituent notre fichier source en terme de référencement officiel Les fichiers thermoall sont les fichiers du thermosalinographe corrigés (surface) Les corrections effectuées sont indiquées dans l'en tête: par exemple pour p1lg1 1 ligne indique la correction appliquée aux données brutes sur la température de proue : TQP = TQP + 0.655 1 ligne indique la correction sur la salinité appliquée pour les données issues du Thermosalinographe SIS du navire ATALANTE : SALTHESIS = SALTHESIS - 0.194 FLAG = 1 1 ligne indique la correction de salinité appliquée pour les données issues du thermosalinographe SBE 26 du LPCM, Labo A : SALTHLPCM = SALTHLPCM + 0.0197 FLAG = 2 Remarque : différence au niveau des fichiers résultats entre pomme 1, 2 et pomme 3 : pomme 3 leg 1 et 2 diffèrent au niveau de trois colonnes sur les quatre dernières : TQP est remplacé par TPRCOR en degré celsius (TPRCOR = TPRISEBRUT - 0.088) SAL est remplacé par SALCOR /1000 (SALCOR = SALBRUT + 0.005) FLAG reste inchangé: flag TSIS est remplacé par TCUVE (température de la cuve) en degré celsius Les deux fichiers de Pomme 3 ,1 pour chaque leg, p3lgyTHERMOall.txt sont similaires à ceux de Pomme1 et 2, mais n’ont pas été constitués de la même manière puisqu’à Pomme 3 seul le thermosalinographe SBE21 de la Thalassa a été mis en route. Le même thermosalinographe du LPCM n’a pas été utilisé. Lors de Pomme 1 et 2 sur l’Atalante le thermo du navire était un thermo SIS susceptible de plus de dérive qu’un SBE 21 et pour cette raison le thermo SBE 21 du LPCM était mis en parallèle. Dans les fichiers thermes de Genavir concernant le Thermosalinographe la navigation n’est pas incorporée. Jean Raunet a donc joint aux fichiers Thermosalinographe issus de Thermes, les fichiers navigations de Thermes après avoir interpolé à la minute et converti le temps en jour julien. La navigation, Latitude et Longitude est également exprimée en DD.MMddddd. TPRCOR est la température de proue corrigée selon l’ équation indiquée dans l’en-tête du fichier. Les valeurs de T et S n’ont pas été filtrées (Bulles, parasites etc)et n’ont donc pas subies d’autres transformations que celles indiquées précédemment. Détail des fichiers "pxlgyTHERMOall.txt" : Contient : 1 ligne de titre ex : POMME2 - LEG2 - SURFACE - FICHIERS THERMOSALINO CORRIGES 1 ligne indiquant la correction appliquée aux données brutes sur la température de proue 1 ligne indiquant la correction sur la salinité appliquée pour les données issues du Thermosalinographe SIS du navire ATALANTE 1 ligne indiquant la correction de salinité appliquée pour les données issue du thermosalinographe SBE 26 du LPCM, Labo A deux lignes de titre des colonnes avec unités Colonne 1 : jour julien de l’année 2001, en jour centésimal, avec 5 décimales, incrément d’une minute.le temps de référence est le temps TU, issue de la centrale Atalante. Colonne 2 le jour (JJ) Colonne 3, le mois (MM) Colonne 4, l’année du siècle (2001), AA Colonne 5, l’heure TU, hh Colonne 6, les minutes, mm Colonne 7, la latitude, en degrés DD. Minutes MM et décimales de minute ddddddd, DD.MMddddd, + pour l’hémisphère Nord Colonne 8, la longitude, en degrés DD , minutes (MM) et décimales de minute, -DD.MMddddd, - pour Ouest Colonne 9, TQP, température de surface de l’eau de mer prise et mesurée à la proue du navire. Les valeurs brutes sont celles issue de la centrale termes. Elles ont été corrigées du fateur indiqué dans l’entête. Degrés Celsius, 3 décimales Colonne 10, Salinité (PSU, indique /1000). Colonne 11, Flag indiquant si la salinité est issue du Thermosalinographe SIS (flag 1) ou du thermosalinigraphe LPCM, (flag2). Ce dernier a été privilégié, car plus stable, amis l’autre Thermosalinographe a été retenu pour les données manquantes. Colonne 12, Température di Thermosalinographe donnée à titre indicatif. La comparaison avec TQP permet de regarder le décalage temporelle entre la salinité et la température de proue (de l’ordre de 5 minutes) du au temps de transit dans les quelques 60 mètres de tuyaux. Ce décalage n’a pas été appliqué. Les données sont sans trou dans le temps. Des valeurs négatives sont appliquée pour des valeurs aberrantes ou manquantes. Pour la salinité, il arrive que le circuit d’eau soit interrompu, pour calibration du fluorimètre ou involontairement.. Les valeurs sont alors proches de zéro en S. Les deux fichiers de Pomme 3 ,1 pour chaque leg, p3lgyTHERMOall.txt sont similaires à ceux de Pomme1 et 2, mais n’ont pas été constitués de la même manière puisqu’à Pomme 3 seul le thermosalinographe SBE21 de la Thalassa a été mis en route. Le même thermosalinographe du LPCM n’a pas été utilisé. Lors de Pomme 1 et 2 sur l’Atalante le thermo du navire était un thermo SIS susceptible de plus de dérive qu’un SBE 21 et pour cette raison le thermo SBE 21 du LPCM était mis en parallèle. Dans les fichiers thermes de Genavir concernant le Thermosalinographe la navigation n’est pas incorporée. Jean Raunet a donc joint aux fichiers Thermosalinographe issus de Thermes, les fichiers navigations de Thermes après avoir interpolé à la minute et converti le temps en jour julien. La navigation, Latitude et Longitude est également exprimée en DD.MMddddd. TPRCOR est la température de proue corrigée selon l’ équation indiquée dans l’en-tête du fichier. Les valeurs de T et S n’ont pas été filtrées (Bulles, parasites etc)et n’ont donc pas subies d’autres transformations que celles indiquées précédemment. J’ai déjà eu avec A. Paci des échanges d’information sur les bugs dans ces fichiers. Je peux faire parvenir copie des mails Les fichiers thermoall pour p3l1 contiennent une absence d'informations pour la journée du 30 août 2001 de 7h55 à 19h00, donc on a mis des NaN Détails complémentaires : Les "NaN" signifient Not a Number selon la convention IEEE. On les emploie lors d'absence de données, le langage Matlab n'acceptant pas de vide dans les tableaux.